More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1906 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1906  shikimate kinase  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  40.37 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0631  shikimate kinase  40.85 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0688988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  41.88 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  42.5 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  37.27 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  41.36 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  36.59 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.5 
 
 		 195 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  36.25 
 
 		 458 aa  98.2  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  41.36 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  42.68 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  37.8 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  39.64 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  39.01 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  39.01 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  37.95 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  36.97 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.04 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.79 
 
 		 539 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  37.42 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  38.04 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  37.35 
 
 		 173 aa  91.3  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  33.54 
 
 		 165 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  35.76 
 
 		 189 aa  90.5  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.81 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  37.28 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  38.04 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.31 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  34.94 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  38.55 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  35.15 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  32.92 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  37.95 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  33.54 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  37.74 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  35.19 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  37.42 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  34.55 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  34.94 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.65 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  34.78 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  35.85 
 
 		 192 aa  87.8  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  36.94 
 
 		 454 aa  87.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  37.42 
 
 		 165 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  35.37 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  36.81 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  35.4 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  32.54 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  33.53 
 
 		 180 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  33.53 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  34.57 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  42.98 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.65 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  36.09 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  36.09 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  36.09 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  36.09 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  34.38 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  35.44 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  36.09 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  34.62 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  36.25 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  35.76 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  34.1 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  37.89 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  34.73 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  35 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  35.58 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  35.54 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  39.07 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  32.93 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  37.65 
 
 		 191 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  37.09 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  35.12 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.2 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.2 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.12 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  38.06 
 
 		 209 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  37.34 
 
 		 266 aa  84.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  36.2 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  35.15 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  37.35 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  37.42 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  40.16 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  36.36 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  37.18 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  34.76 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  37.91 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  32.92 
 
 		 462 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  31.01 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 579 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 604 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  33.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  33.95 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  36.6 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  36.6 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>