128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3221 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  68.42 
 
 		 755 aa  1057    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  73.96 
 
 		 765 aa  1165    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  81.82 
 
 		 759 aa  1297    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 760 aa  1551    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  41.4 
 
 		 738 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  46.98 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  46.21 
 
 		 482 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  44.67 
 
 		 467 aa  360  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  45.25 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  43.51 
 
 		 470 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  42.53 
 
 		 450 aa  334  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  43.21 
 
 		 485 aa  330  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  41.08 
 
 		 717 aa  319  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  40.52 
 
 		 798 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  40.37 
 
 		 717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  40.14 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  38.81 
 
 		 524 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  50.33 
 
 		 712 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  50 
 
 		 712 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  50 
 
 		 712 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  49.02 
 
 		 720 aa  290  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  49.83 
 
 		 716 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  48.69 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  46.54 
 
 		 479 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  35.42 
 
 		 782 aa  283  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  39.2 
 
 		 749 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  35.3 
 
 		 725 aa  273  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  37.23 
 
 		 695 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  37.04 
 
 		 526 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  37.04 
 
 		 526 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  44.62 
 
 		 731 aa  257  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  35.92 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  35.92 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  34.97 
 
 		 882 aa  243  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  41.61 
 
 		 682 aa  236  9e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  35.99 
 
 		 746 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  35.99 
 
 		 746 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.97 
 
 		 843 aa  224  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  32.49 
 
 		 842 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  35.78 
 
 		 900 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  29.01 
 
 		 723 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  33.83 
 
 		 697 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  31.58 
 
 		 857 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  31.53 
 
 		 554 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.87 
 
 		 774 aa  177  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.25 
 
 		 955 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  31.78 
 
 		 788 aa  171  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  38.28 
 
 		 612 aa  169  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  30.41 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  30.68 
 
 		 770 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  35.64 
 
 		 613 aa  167  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  30.92 
 
 		 757 aa  154  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  30.71 
 
 		 799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.48 
 
 		 632 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  24.92 
 
 		 531 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  36.32 
 
 		 930 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.49 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.13 
 
 		 828 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  40.59 
 
 		 739 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.57 
 
 		 769 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  28.02 
 
 		 540 aa  101  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  37.77 
 
 		 841 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  42.35 
 
 		 272 aa  87.4  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  31.62 
 
 		 838 aa  84.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  31.5 
 
 		 834 aa  84  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  26.09 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  28.67 
 
 		 979 aa  76.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.44 
 
 		 771 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  35.71 
 
 		 847 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  19.89 
 
 		 1000 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  25.25 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  22.69 
 
 		 1145 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  34.72 
 
 		 845 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  27.18 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  22.47 
 
 		 1172 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  22.04 
 
 		 1172 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  25.7 
 
 		 1061 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.3 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.97 
 
 		 1285 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  31.01 
 
 		 624 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  39.73 
 
 		 788 aa  63.9  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  23.79 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.64 
 
 		 978 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  24.27 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  26.44 
 
 		 610 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  39.51 
 
 		 344 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  21.76 
 
 		 777 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  39.53 
 
 		 348 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  30.89 
 
 		 351 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 1039 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  30.38 
 
 		 732 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  23.55 
 
 		 777 aa  53.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  32.54 
 
 		 880 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.57 
 
 		 1036 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  30.04 
 
 		 277 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  23.55 
 
 		 777 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  22.73 
 
 		 777 aa  51.6  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  22.73 
 
 		 777 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  22.73 
 
 		 777 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>