More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2369 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1316 aa  2705  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  40.51 
 
 
2035 aa  371  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 
1177 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
1765 aa  369  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.83 
 
 
1653 aa  365  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
833 aa  365  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1333 aa  363  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02305e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1245 aa  360  1e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
1326 aa  358  3e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.36 
 
 
2213 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  40.59 
 
 
1763 aa  354  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
1284 aa  353  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
1768 aa  352  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1303 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
1005 aa  351  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.82 
 
 
1014 aa  351  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.3 
 
 
1233 aa  349  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1548 aa  348  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  40.41 
 
 
1236 aa  348  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
920 aa  347  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
1230 aa  347  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1009 aa  346  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.86 
 
 
1765 aa  346  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
1266 aa  345  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
1128 aa  343  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
1202 aa  343  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1087 aa  343  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.82 
 
 
1135 aa  342  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
1236 aa  343  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.52 
 
 
1331 aa  342  3e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
1582 aa  342  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  2.34203e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
1767 aa  342  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
1234 aa  341  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1767 aa  341  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
1611 aa  340  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 
1767 aa  340  1e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
2654 aa  339  2e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
816 aa  338  3e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1245 aa  337  6e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
1165 aa  337  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
1021 aa  336  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 
916 aa  337  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  39.96 
 
 
1200 aa  337  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.44 
 
 
1442 aa  336  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  38.75 
 
 
1683 aa  336  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1782 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  39.81 
 
 
1439 aa  336  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1238 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1238 aa  335  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1238 aa  334  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1238 aa  334  7e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1784 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1310 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
1236 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1398 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1236 aa  332  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  39.33 
 
 
1030 aa  333  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
1234 aa  333  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
1236 aa  333  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1057 aa  332  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
1786 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  39.71 
 
 
1188 aa  332  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
1166 aa  331  5e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1240 aa  331  5e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
929 aa  331  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
1681 aa  330  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
1622 aa  330  1e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  38.25 
 
 
1686 aa  330  1e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
946 aa  329  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
1681 aa  328  4e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
705 aa  328  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 
1245 aa  327  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1267 aa  327  8e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  39.82 
 
 
977 aa  326  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
977 aa  325  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
818 aa  324  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1033 aa  324  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1771 aa  324  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1788 aa  323  2e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
758 aa  322  2e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
1193 aa  322  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1363 aa  321  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
964 aa  321  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
1820 aa  321  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
957 aa  320  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.17317e-06 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
770 aa  320  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.48 
 
 
1346 aa  320  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1397 aa  319  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1255 aa  319  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
812 aa  320  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1603 aa  319  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.23 
 
 
941 aa  319  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  40.37 
 
 
1418 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
1303 aa  318  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  39.86 
 
 
1417 aa  318  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.67 
 
 
923 aa  318  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  37.2 
 
 
1214 aa  317  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
899 aa  316  1e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.55 
 
 
1574 aa  317  1e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1340 aa  316  2e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>