146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1889 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 224 aa  463  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  39.72 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  45 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  37.1 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  33.8 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  33.51 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.68 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.44 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.61 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.33 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  35.2 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.44 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.38 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  33.59 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  35.61 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  34.68 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.35 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.09 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.19 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  30.94 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  33.83 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.9 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.83 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  32.82 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  32.82 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  39.58 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  36.03 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 175 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.88 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.43 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  33.14 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.5 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  31.11 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  38.39 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.71 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.81 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.3 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.67 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  35.45 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  43.18 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.71 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  38.68 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  35.92 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.17 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.19 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  25.25 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  28.68 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.91 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  31.25 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  34.68 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  34.68 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.1 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.77 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.23 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.38 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.81 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.87 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.23 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.37 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  26.03 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.54 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.33 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  30.47 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.23 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.77 
 
 		 136 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.61 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.41 
 
 		 153 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  29.03 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  32.88 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  32.88 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.33 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  33.77 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.4 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.15 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.61 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  34.04 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  28.9 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.58 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  32.7 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.61 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.91 
 
 		 164 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.25 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  23.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>