More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1782 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 404 aa  838    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  36.45 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  32.94 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  30.86 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  30.27 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.65 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.25 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.05 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.99 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1373  metallo cofactor biosynthesis protein  26.2 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 496 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 327 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.47 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.14 
 
 		 349 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 358 aa  99.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 501 aa  96.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.84 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.3 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26 
 
 		 561 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.78 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.04 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.25 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.51 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.17 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.09 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  33.55 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  34.12 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.32 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.51 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 346 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>