More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0967 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  100 
 
 		 373 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  53.44 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  53.09 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  51.32 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  44.16 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  43.61 
 
 		 293 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  62.69 
 
 		 472 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  40.06 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.18 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  40.91 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  38.22 
 
 		 298 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  39.47 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.22 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  42.68 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.82 
 
 		 294 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  37.58 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  41.12 
 
 		 302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  38.71 
 
 		 308 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  40.32 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.16 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  39.48 
 
 		 302 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  42.63 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  38.64 
 
 		 302 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  38.83 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.22 
 
 		 295 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.86 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.86 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.86 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  40.58 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.58 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.71 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  42.86 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  40.71 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.77 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  40 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.51 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.51 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.51 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  41.69 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  40.52 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  39.47 
 
 		 346 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.95 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  38.11 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  42.72 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  39.74 
 
 		 310 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  42.53 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  42.72 
 
 		 311 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  39.54 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.6 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  37.46 
 
 		 306 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.1 
 
 		 301 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.44 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.74 
 
 		 298 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  41.42 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.87 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  35.83 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  39.62 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  42.07 
 
 		 343 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  42.07 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  35.83 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  38.16 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.06 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  36.98 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  39.62 
 
 		 315 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  41.23 
 
 		 328 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.39 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  34.42 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.59 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  39.29 
 
 		 329 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  38.93 
 
 		 300 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  36.57 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  40.63 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.86 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  38.49 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.16 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.86 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.86 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.83 
 
 		 307 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  37.79 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.62 
 
 		 311 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.86 
 
 		 319 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  34.08 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  39.5 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  35.85 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.58 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  37.06 
 
 		 299 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  40.6 
 
 		 317 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>