More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1040 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.9 
 
 		 933 aa  1068    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.62 
 
 		 949 aa  1037    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  57.9 
 
 		 949 aa  1070    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  59.41 
 
 		 957 aa  1056    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.55 
 
 		 948 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  66.99 
 
 		 951 aa  1255    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.86 
 
 		 949 aa  1068    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.48 
 
 		 949 aa  1045    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  100 
 
 		 934 aa  1912    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.37 
 
 		 957 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.72 
 
 		 948 aa  1036    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.61 
 
 		 948 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.96 
 
 		 949 aa  1070    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.61 
 
 		 948 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.86 
 
 		 949 aa  1067    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.86 
 
 		 949 aa  1069    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  66.74 
 
 		 951 aa  1260    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  56.96 
 
 		 915 aa  1029    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.37 
 
 		 949 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  75.03 
 
 		 955 aa  1438    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  57.96 
 
 		 949 aa  1070    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  58.07 
 
 		 949 aa  1072    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  57.9 
 
 		 933 aa  1068    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 936 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 925 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  33.71 
 
 		 935 aa  361  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  35.01 
 
 		 936 aa  350  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1074 aa  347  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  34.92 
 
 		 1084 aa  340  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  35.15 
 
 		 1083 aa  334  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  34.65 
 
 		 1053 aa  318  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.3 
 
 		 1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1070 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 909 aa  294  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1022 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  29.63 
 
 		 1156 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  35.38 
 
 		 951 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  32.17 
 
 		 774 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1436 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  29.65 
 
 		 1175 aa  274  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1436 aa  274  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  32.59 
 
 		 1064 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 1032 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1001 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1002 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  33.28 
 
 		 855 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  30.68 
 
 		 1098 aa  266  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 921 aa  266  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.8 
 
 		 1129 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1305 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 1032 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  34.8 
 
 		 988 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.4 
 
 		 1499 aa  263  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 1014 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  35.06 
 
 		 785 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  35.14 
 
 		 785 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  35.14 
 
 		 785 aa  261  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  29 
 
 		 1082 aa  260  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 758 aa  260  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  34.16 
 
 		 931 aa  260  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 1082 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  35.59 
 
 		 785 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  29 
 
 		 1082 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  35.53 
 
 		 786 aa  260  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 833 aa  259  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.07 
 
 		 1442 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1194 aa  258  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  40.22 
 
 		 1088 aa  258  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  33.46 
 
 		 952 aa  257  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1266 aa  257  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 916 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  33.58 
 
 		 994 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 745 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1202 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.45 
 
 		 1177 aa  255  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 1255 aa  255  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1771 aa  255  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1767 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1767 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1767 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 		 1029 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1768 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  33.27 
 
 		 778 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  34.94 
 
 		 779 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.02 
 
 		 1001 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  33.53 
 
 		 1309 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1692 aa  251  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.59 
 
 		 933 aa  251  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 914 aa  251  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1003 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 1782 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 830 aa  250  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.63 
 
 		 1763 aa  250  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1433 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 928 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1784 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1788 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 925 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 1786 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>