More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2070 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  74.88 
 
 		 450 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  74.88 
 
 		 447 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  73.58 
 
 		 438 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  75.6 
 
 		 447 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  74.64 
 
 		 446 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  74.88 
 
 		 447 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  74.88 
 
 		 450 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  73.75 
 
 		 454 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  74.88 
 
 		 450 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  100 
 
 		 440 aa  890    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  73.43 
 
 		 455 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  74.88 
 
 		 447 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  72.21 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  71.6 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  72.68 
 
 		 440 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  71.84 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  73.19 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  74.28 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  71.84 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  72.41 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  62.71 
 
 		 449 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  79.49 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  79.49 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  56.25 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  56.25 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  49.25 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.77 
 
 		 624 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  46.04 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  48.5 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  49.03 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  49.88 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  46.38 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  47.5 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  50.99 
 
 		 468 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  43.98 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  45.87 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 463 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  44.47 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  48.97 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  48.42 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  44.8 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.39 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  46.32 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.89 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  44.8 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.47 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  44.47 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  42.89 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  47.16 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  46.52 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  44.63 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 449 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  46.37 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  46.54 
 
 		 421 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  46.99 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  46.46 
 
 		 677 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  52.08 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  51.8 
 
 		 484 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  51.8 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.16 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  44.92 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  49.47 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  43.53 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  43.53 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  49.3 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  43.53 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  51.79 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  49.58 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  50.88 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  45.12 
 
 		 491 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  51.67 
 
 		 416 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  47.01 
 
 		 452 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  43.29 
 
 		 455 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  49.33 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.03 
 
 		 634 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  43 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  48.39 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  43.72 
 
 		 492 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  48.03 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  43.47 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  43.17 
 
 		 457 aa  345  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  43 
 
 		 454 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  43 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  43 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  47.24 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.34 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>