82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0891 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  65.1 
 
 		 169 aa  207  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  51.37 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  46.76 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  44.32 
 
 		 198 aa  90.9  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  46.59 
 
 		 196 aa  84  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.16 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  33.75 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 217 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  37.33 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 634 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  34.23 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  34.21 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  33.33 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  31.97 
 
 		 295 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  43.59 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  35.42 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  34.44 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  36.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  38.46 
 
 		 511 aa  53.9  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  28.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  36.17 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  32.29 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  31.25 
 
 		 424 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.77 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  30.61 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.9 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.9 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.9 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  25.52 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  35.29 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  29.86 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  32.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  30.71 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.21 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  35.96 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  27.5 
 
 		 278 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  35.53 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.77 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.77 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  28.57 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  37.08 
 
 		 537 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0792  hypothetical protein  26.52 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 		 415 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  25.19 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 		 202 aa  44.3  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  30.6 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  26.39 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.31 
 
 		 406 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  31.88 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  25.66 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  35.8 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 536 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  34.78 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  30.88 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  29.85 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  22.45 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.47 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  38.03 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  30.53 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  31.17 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  31.51 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  27.08 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  34.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  35.9 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  30.77 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  35.38 
 
 		 398 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  28.39 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>