More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2330 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  58.02 
 
 		 514 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  58.88 
 
 		 520 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  68.62 
 
 		 506 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  64.76 
 
 		 518 aa  687    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  65.69 
 
 		 518 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  70.36 
 
 		 512 aa  755    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  70.47 
 
 		 504 aa  720    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  100 
 
 		 508 aa  1042    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  61.43 
 
 		 516 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  64.74 
 
 		 520 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  69.38 
 
 		 506 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  66.6 
 
 		 532 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  70.55 
 
 		 512 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  57.62 
 
 		 514 aa  638    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  58.45 
 
 		 514 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  58.88 
 
 		 520 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  57.65 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  44.66 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  44.06 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  43.23 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  42.89 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  44.14 
 
 		 505 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  41.88 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 506 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  37.05 
 
 		 513 aa  269  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 515 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  34.88 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  32.73 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  32.34 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  31.18 
 
 		 938 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  34.27 
 
 		 511 aa  217  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  33.6 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  31.56 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  28.77 
 
 		 509 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  28.77 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  28.18 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  29.76 
 
 		 595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  32.87 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  33.47 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  27.56 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.92 
 
 		 598 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  32.22 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  30.08 
 
 		 633 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  28.27 
 
 		 645 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  30.92 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  30.48 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 717 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  29.18 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  30.12 
 
 		 708 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  30.36 
 
 		 499 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  30.44 
 
 		 711 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  30.42 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  30.38 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  28.14 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  28.11 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  28.24 
 
 		 517 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.99 
 
 		 740 aa  137  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  29.66 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  28.08 
 
 		 491 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  27.57 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 547 aa  126  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  27.27 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.21 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  27.34 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 722 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.46 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  25.05 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.16 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  26.59 
 
 		 504 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  24.28 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 556 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.59 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  27.9 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  28.02 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.14 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.84 
 
 		 511 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.35 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26.36 
 
 		 518 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  26.36 
 
 		 518 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  26.94 
 
 		 503 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.94 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.47 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.28 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.15 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  26.68 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  26.45 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>