144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0040 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  42.26 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2400  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2447  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2441  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  27.59 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  25.41 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  30.89 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  22.87 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  27.67 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.02 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  24.39 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.04 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  27.51 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  27.01 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.04 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.22 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  27.1 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.28 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  26.46 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  25.54 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 474 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  26.37 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  30.87 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 477 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  21.59 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  20.7 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  20.72 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  20.7 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  26.73 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.65 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.35 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.65 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.42 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.42 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.01 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  33.12 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.42 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.42 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.14 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>