More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6467 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 351 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  31.3 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  33.1 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  32.86 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0059  FecR protein  25.49 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0442  anti-FecI sigma factor, FecR  31.18 
 
 		 262 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0522826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  32.64 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  31.64 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4707  anti-FecI sigma factor, FecR  26.37 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1461  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2303  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  27.99 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0357  anti-FecI sigma factor, FecR  26.85 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.86 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.69 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  30.52 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  28.3 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.34 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0867  anti-FecI sigma factor, FecR  22.51 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  25 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  23.77 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  24.93 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5418  anti-FecI sigma factor, FecR  24.52 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  26.27 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  24.13 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  26.43 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  23.48 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  26.88 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1426  anti-FecI sigma factor, FecR  24.72 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2220  anti-FecI sigma factor, FecR  26.99 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  27.02 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  24.67 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  26.27 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2450  anti-FecI sigma factor, FecR  23.69 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5522  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00063223  normal  0.246639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  25.4 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  27.44 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1792  anti-FecI sigma factor, FecR  24.35 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  24.92 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  27.23 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  27.06 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  29.69 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  27.66 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  25.91 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  26.09 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  31.84 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  25.83 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  26.76 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  27.32 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.44 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  29.72 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0658  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  24.34 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  28.63 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  29.79 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3451  anti-FecI sigma factor, FecR  45.79 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0430565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3705  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  25.07 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1491  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  26.87 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  24.19 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  24.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  26.57 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2190  anti-FecI sigma factor, FecR  25.78 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300153  hitchhiker  0.000017551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2206  anti-FecI sigma factor, FecR  26.27 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  26.15 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  28.35 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2266  anti-FecI sigma factor, FecR  24.76 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  27.34 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  26 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  38.1 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2763  anti-FecI sigma factor, FecR  23.42 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.510605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.25 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2401  anti-FecI sigma factor, FecR  27.64 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  26.58 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  28.72 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  26.43 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  24.74 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>