More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0658 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0658  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 379 aa  731    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  26.84 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  35.77 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  31.03 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.57 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  33.51 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  32.26 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  33.15 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  29.02 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  34.63 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 332 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  32.62 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0678  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  29.46 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0049  anti-FecI sigma factor, FecR  38.65 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  33.76 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  31.55 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  30.27 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  29.46 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  28.93 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  35.75 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  34.15 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1658  anti-FecI sigma factor, FecR  33.49 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2317  anti-FecI sigma factor, FecR  36.15 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  29.32 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  33.33 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.96 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  28.85 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1745  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  29.67 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  30.27 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  35.38 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  30.8 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.02 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2228  anti-FecI sigma factor, FecR  31.67 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28991  normal  0.282396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  34.27 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  27.87 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  30.85 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  30.21 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  32.38 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  28.86 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.87 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  30.05 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7228  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  31.53 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5799  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.168322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.18 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  31.15 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  27.6 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  33.8 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1102  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  31.35 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  29.59 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  27.87 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  39.05 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  33.7 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  35.04 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  29.23 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  26.98 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  30.73 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  26.21 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4781  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  31.18 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3959  anti-FecI sigma factor, FecR  27.34 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2117  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  33.62 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.25 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.29 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  30.08 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  28.14 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  30.32 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.67 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  30.26 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  28.5 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  24.71 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  32.09 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  34.13 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  24.31 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>