268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1052 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.04 
 
 		 865 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  42.26 
 
 		 848 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  100 
 
 		 914 aa  1865    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.2 
 
 		 865 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.96 
 
 		 838 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  37.76 
 
 		 895 aa  545  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  35.8 
 
 		 891 aa  536  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.88 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  36.8 
 
 		 900 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  37.32 
 
 		 860 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  31.49 
 
 		 830 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  31.26 
 
 		 858 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.99 
 
 		 831 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.95 
 
 		 827 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.3 
 
 		 836 aa  429  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.8 
 
 		 821 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  31.7 
 
 		 820 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.47 
 
 		 834 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  25.2 
 
 		 818 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.47 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  25.47 
 
 		 807 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.32 
 
 		 905 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 826 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.19 
 
 		 826 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 826 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  23.52 
 
 		 826 aa  138  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  23.43 
 
 		 826 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 826 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 826 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 826 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  21.32 
 
 		 820 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  22.76 
 
 		 785 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  23.61 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.85 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.9 
 
 		 895 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 827 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  22.19 
 
 		 827 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  22.06 
 
 		 827 aa  131  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  23.15 
 
 		 765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  25 
 
 		 887 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.79 
 
 		 827 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  23.36 
 
 		 827 aa  129  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  21.94 
 
 		 806 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.94 
 
 		 793 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.77 
 
 		 793 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.58 
 
 		 752 aa  126  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 		 799 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 827 aa  125  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  22.15 
 
 		 788 aa  124  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.88 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.11 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  22.75 
 
 		 781 aa  122  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.6 
 
 		 787 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.75 
 
 		 803 aa  122  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.14 
 
 		 913 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.01 
 
 		 787 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  22.95 
 
 		 787 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.57 
 
 		 896 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.32 
 
 		 770 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 		 784 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  22.44 
 
 		 785 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.81 
 
 		 808 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  22.82 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  21.93 
 
 		 827 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.24 
 
 		 785 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  21.27 
 
 		 893 aa  119  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  23.03 
 
 		 896 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.71 
 
 		 786 aa  118  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.42 
 
 		 895 aa  118  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.71 
 
 		 786 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 845 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.09 
 
 		 796 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.96 
 
 		 765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 910 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.47 
 
 		 763 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  22.19 
 
 		 790 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  23.72 
 
 		 926 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  22.72 
 
 		 758 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.81 
 
 		 768 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.69 
 
 		 768 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.81 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.81 
 
 		 768 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.81 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  21.96 
 
 		 765 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  21.97 
 
 		 768 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.12 
 
 		 769 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  23.93 
 
 		 843 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  22.28 
 
 		 844 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  23.09 
 
 		 802 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.12 
 
 		 769 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.12 
 
 		 769 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.43 
 
 		 769 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  21.96 
 
 		 888 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.13 
 
 		 790 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.28 
 
 		 781 aa  114  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.59 
 
 		 791 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.47 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.54 
 
 		 769 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.46 
 
 		 797 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>