More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1690 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  71.01 
 
 		 171 aa  268  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  62.05 
 
 		 171 aa  229  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  61.31 
 
 		 170 aa  227  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  60.87 
 
 		 164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  62.73 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  61.11 
 
 		 164 aa  210  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  39.46 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  41.67 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  41.76 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  35.57 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.01 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  37.01 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.03 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  32.45 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  41.76 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  30.65 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  33.12 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  36.63 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  27.54 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.58 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  31.03 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>