More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1509 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  75.21 
 
 
253 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  73.77 
 
 
244 aa  374  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  78.45 
 
 
251 aa  371  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  74.38 
 
 
244 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  70.69 
 
 
245 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  64.29 
 
 
254 aa  309  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  65.37 
 
 
235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  64.14 
 
 
251 aa  308  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  64.22 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  64.53 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  61.8 
 
 
238 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  64.1 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.5 
 
 
245 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  61.9 
 
 
245 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  62.34 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  60.76 
 
 
238 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  61.4 
 
 
236 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  59.31 
 
 
234 aa  294  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
244 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  62.34 
 
 
236 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  62.03 
 
 
240 aa  293  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  57.08 
 
 
248 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 
244 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  58.87 
 
 
235 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  57.08 
 
 
244 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 
235 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  57.14 
 
 
234 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  57.14 
 
 
234 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  60 
 
 
236 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  61.09 
 
 
241 aa  278  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  58.01 
 
 
234 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  60.92 
 
 
250 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  55.65 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  56.09 
 
 
245 aa  264  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.88 
 
 
236 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.02 
 
 
236 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  53.04 
 
 
233 aa  250  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  50.87 
 
 
233 aa  248  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  49.14 
 
 
232 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.56 
 
 
234 aa  245  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
233 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
233 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  50.67 
 
 
234 aa  244  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  48.71 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.3 
 
 
233 aa  242  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  49.57 
 
 
233 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.72 
 
 
234 aa  241  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  52.7 
 
 
239 aa  241  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  48.7 
 
 
233 aa  240  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  50.43 
 
 
236 aa  241  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  50.64 
 
 
234 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  48.48 
 
 
233 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
233 aa  239  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.14 
 
 
232 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
235 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.11 
 
 
233 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.22 
 
 
236 aa  218  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
246 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  47.39 
 
 
243 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.2 
 
 
235 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.03 
 
 
604 aa  206  4e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  47.73 
 
 
230 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.42 
 
 
233 aa  203  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
252 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
345 aa  202  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  44.35 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.52 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.98 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  46.19 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.54 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
234 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  48.66 
 
 
234 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 
231 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.98 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45.54 
 
 
229 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
229 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  49.53 
 
 
254 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.37 
 
 
268 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  44.35 
 
 
235 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  46.36 
 
 
227 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 
227 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.1 
 
 
234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.22 
 
 
266 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.16 
 
 
237 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
233 aa  191  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.54 
 
 
234 aa  191  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  44.69 
 
 
225 aa  191  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.56 
 
 
225 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.05 
 
 
230 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  44.25 
 
 
240 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  43.52 
 
 
253 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.56 
 
 
235 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>