149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2226 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.65 
 
 		 402 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  35.29 
 
 		 404 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  36.87 
 
 		 428 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  37.2 
 
 		 413 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  41.84 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.17 
 
 		 416 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  36.41 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 		 406 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  35.03 
 
 		 448 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 445 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  34.85 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.56 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  34.65 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  29.65 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.29 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.73 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  27.55 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31 
 
 		 403 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  29.59 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  26.53 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 		 408 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 		 487 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  28.71 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  25.96 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  27.04 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  28.06 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  31.09 
 
 		 429 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  25.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  36.84 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  28.37 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  26.4 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  26.56 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  28.79 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  25.65 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  25.73 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  24.88 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  28.08 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  20.62 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  30.69 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  26.13 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  26.09 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  27.92 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 		 419 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  25.85 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  27.88 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  26.89 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.92 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.23 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  29.7 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  25.85 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  22.73 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  27.86 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  24 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  25.5 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  24.49 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  24.21 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  22.8 
 
 		 406 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 424 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49160  putative sensor protein  33.09 
 
 		 1120 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000588584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  27.41 
 
 		 413 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  25.87 
 
 		 405 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3143  diguanylate phosphodiesterase  34.53 
 
 		 425 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.375725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4198  putative sensor protein  30.89 
 
 		 1105 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  35.19 
 
 		 450 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 458 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  34.48 
 
 		 460 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 723 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 		 1021 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.06 
 
 		 637 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.87 
 
 		 808 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000289521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  29.08 
 
 		 418 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4025  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.62 
 
 		 501 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.06 
 
 		 610 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.06 
 
 		 633 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 859 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  31.77 
 
 		 444 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4412  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.68 
 
 		 574 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0317543  normal  0.165306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0208  EAL domain protein  36.67 
 
 		 762 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0388  putative diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 837 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  24.62 
 
 		 412 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 		 627 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3991  putative phosphodiesterase  33.06 
 
 		 668 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.185818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  24.14 
 
 		 412 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 		 596 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000445726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 		 568 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0247  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  26.96 
 
 		 636 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3543  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.45 
 
 		 750 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3823  putative phosphodiesterase  33.06 
 
 		 668 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3887  putative phosphodiesterase  33.06 
 
 		 668 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3931  putative phosphodiesterase  33.06 
 
 		 668 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>