More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3464 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  100 
 
 		 406 aa  832    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  51.49 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  41.29 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  37.06 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  38.79 
 
 		 404 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  39.34 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  38.71 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  38.92 
 
 		 409 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  37.56 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  36.88 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  36.34 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  36.59 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  34.81 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  38.12 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  37.47 
 
 		 402 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  36.91 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  34.59 
 
 		 413 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  35.07 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  35.1 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  31.5 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  32.51 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.42 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  33.17 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  32.01 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  31.46 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  32.24 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.16 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 412 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 431 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  31.78 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.6 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  31 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.42 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.93 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33.5 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  31.51 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  31.37 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  27.59 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.75 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.07 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  29.25 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.04 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  27.75 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 449 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  29.07 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  31.38 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  29.44 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.02 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  27.7 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 444 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.88 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  26.93 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  25.43 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.22 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.42 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  27.48 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  25.5 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  24.32 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  25 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  24.16 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  24.41 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  21.75 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  27.08 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  22.03 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  21.33 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  20.11 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  26.26 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  27.81 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2943  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.15 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  24 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0494  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  28.14 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  25.97 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>