More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3234 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 408 aa  833    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  33.08 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.83 
 
 		 400 aa  222  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 416 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 423 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  31.09 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  31.55 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  33.24 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  31.84 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  29.14 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.51 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.1 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.28 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  28.99 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  28.64 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  32.18 
 
 		 405 aa  189  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  33.15 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  30.48 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  30.73 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.47 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  31.21 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.71 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  29.43 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  31.82 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.29 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  33.52 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  33.7 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  32.05 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  32.18 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.92 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.33 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  34.15 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  30.62 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  30.2 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  32.02 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  29.25 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  31.59 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  28.75 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  34.07 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  27.36 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  29.92 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.55 
 
 		 431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.55 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  27.65 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  29.64 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 464 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  30.46 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  25.06 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 423 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.83 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  25.42 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.49 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  26.38 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.5 
 
 		 460 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.99 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  27.5 
 
 		 450 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.9 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  29.39 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  29.39 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  30.08 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.05 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  28.77 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  24.73 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  21.73 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.68 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  24.47 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  24.86 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  24.58 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  21.5 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  26.15 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1154  hypothetical protein  26.22 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.45 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.65 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0567  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.64 
 
 		 599 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.598217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.17 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  25.62 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.19 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>