More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1612 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 410 aa  835    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  56.54 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  53.54 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  49.26 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  51.12 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  52 
 
 		 411 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  52.5 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  44.88 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  50.75 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  45.57 
 
 		 411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  40 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  41.34 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  37.87 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  41.05 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  36.79 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  38.7 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  35.86 
 
 		 422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  34.5 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  32.24 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.83 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  37.6 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.51 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  32.2 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  34.34 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.25 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  33.67 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  34.34 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  32.84 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  32.96 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  34.06 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  31.27 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  30.49 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  30.98 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.92 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  31.93 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  31 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.03 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  32.17 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  30.32 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  28.89 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  32.62 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  31.75 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.3 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  30.05 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.59 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  29.51 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  29.51 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  30.54 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  29.67 
 
 		 460 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  29.95 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  28.34 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  27.43 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  31.15 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  28.81 
 
 		 487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  29 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  30.83 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  29.64 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  28.53 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.61 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  28.71 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  29.36 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.8 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  30.16 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.33 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.04 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26.27 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.79 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  30.21 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  30.21 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  26.08 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  23.53 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.81 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  26.61 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  37.23 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  25.62 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  22.68 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  22.96 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  28.23 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  30.29 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  22.31 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  23.13 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  25.65 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  25.5 
 
 		 242 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>