More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1776 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 448 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  72.88 
 
 		 447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  73.18 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  42.82 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  40.95 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  40.4 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 		 411 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  41.73 
 
 		 450 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  37.2 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  40.29 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  44.47 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  35.93 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  38.48 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 419 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  38.98 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  36.93 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  38.2 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33.15 
 
 		 410 aa  206  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  30.79 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  34.55 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  33.88 
 
 		 409 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.72 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  33.88 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  33.51 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  36.36 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  34.15 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  32.76 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  35.86 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  31.23 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.51 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  30.41 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  34.97 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  31.47 
 
 		 406 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.3 
 
 		 407 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  31.3 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  34.39 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.56 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.72 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.61 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  30.21 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  30.73 
 
 		 406 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.38 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.88 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  30.11 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  32.26 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  31.07 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  32.82 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  31.07 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  29.57 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  32.57 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  34.83 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  31.59 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  31.94 
 
 		 428 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  30.95 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  29.47 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  27.37 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  28.84 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  32.37 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  28.73 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  29.85 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  34.26 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 403 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  24.51 
 
 		 411 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.04 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  30.45 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.86 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  31.25 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.39 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  25.58 
 
 		 463 aa  91.3  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  35.35 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  27.21 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.09 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.33 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  21.53 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  21.53 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3076  diguanylate phosphodiesterase  34.67 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25.09 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.21 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.38 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185981  normal  0.624417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  34.19 
 
 		 817 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.866609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.24 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  36.22 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4011  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 817 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.76 
 
 		 1064 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.530958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>