232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2930 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  100 
 
 		 406 aa  840    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  54.11 
 
 		 407 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  54.64 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  52.23 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  46.8 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  44.31 
 
 		 404 aa  358  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  43.46 
 
 		 404 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  38.48 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  35.98 
 
 		 408 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  35.24 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  39.01 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  36.59 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  35.89 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  33.58 
 
 		 413 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  35.43 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 415 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.84 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.58 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  31.33 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  30.05 
 
 		 413 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  30.42 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  35.28 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.2 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.3 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  30.58 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.22 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  28.82 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  30.24 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  30.06 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  28.64 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  28.17 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  27.82 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  26.5 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  27.94 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  28.68 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.33 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 429 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  27.7 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.54 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  24.44 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 448 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  27.38 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  27.54 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  22.52 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  30.55 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.3 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26.7 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  24.13 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  23.79 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.64 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.24 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.41 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  23.3 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  28.24 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  27.84 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  30.43 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  21.84 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  26.34 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  28.72 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  24.4 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  21.78 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  25 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  20.49 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  21.74 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4484  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.29 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  26 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  21.74 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  19.26 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  20.51 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>