96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2044 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  100 
 
 		 398 aa  800    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  40.78 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  33.45 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  25.91 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.24 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  24.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  24.55 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  27.38 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  25.18 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  24.44 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  23.61 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  20.62 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  27.78 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  21.74 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  24.75 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  24.36 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  26.79 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  21.47 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  23.83 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  23.55 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  19.26 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  25.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.55 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.29 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  21.38 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  22.36 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  23.13 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  23.66 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  22.41 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  23.05 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  19.79 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  23.1 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  22.68 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.36 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  25.18 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 287 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.77 
 
 		 284 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  35.06 
 
 		 275 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 288 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  37.88 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  23.23 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  37.88 
 
 		 256 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  37.88 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  22.65 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  37.88 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  38.89 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  37.88 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  28.72 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  24.29 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  36.36 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  25.17 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  32.71 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  24.31 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  33.7 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  23.24 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  22.75 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  21.4 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  22.66 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  24.31 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  34.85 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  36.92 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  23.13 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  19.75 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  25.41 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  36.51 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  32.88 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  24.09 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  27.22 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.46 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  19.83 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  30.99 
 
 		 852 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  36 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 		 279 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  21.91 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.86 
 
 		 833 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  32.31 
 
 		 836 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  45.1 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>