103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3725 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  100 
 
 		 378 aa  768    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  46.4 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  46.26 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  48.13 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  46.73 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  46.73 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  45.33 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  40.5 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  40.5 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  39.51 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  42.93 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.09 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  39.25 
 
 		 464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  31.2 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.02 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  33.55 
 
 		 480 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  32.84 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  35.68 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  26.42 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.55 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  30.42 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  25.94 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  30.4 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  26.03 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  30.13 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  24.16 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  29.83 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 413 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  28.77 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  27.95 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.5 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  27.35 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  29.57 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  30.47 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  26.52 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  29.02 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  29.21 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  29.33 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  32.5 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  27.91 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  28.67 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  30.62 
 
 		 412 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  29.58 
 
 		 424 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 403 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  24.75 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  30.52 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  28.86 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  27.81 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  31.47 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  27.07 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  25.73 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  26.46 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  25.42 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  22.88 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  29.15 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  25.32 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  29.77 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  30.22 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  24.07 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  29.74 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  24.76 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  22.52 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  27.07 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  28.19 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.55 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  26.36 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  21.76 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.73 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.62 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  24.73 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  25.23 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.62 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  26.3 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  22.12 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  24.47 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  22.97 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  23.28 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 650 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1053  diguanylate cyclase  42.67 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  26.64 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  22.75 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>