113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2723 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  100 
 
 		 399 aa  809    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  56.61 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  29.22 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  29.66 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  28.4 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  44.66 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  31.2 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  42.72 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  42.72 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  29.62 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  41.95 
 
 		 449 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  43.69 
 
 		 448 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  27.25 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  27.29 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  34.13 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  38.58 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  31.68 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  37.5 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  35.29 
 
 		 438 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  24.14 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  28.38 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.33 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  33.16 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  33.13 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  35.57 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  33.77 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  35.2 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  24.31 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.73 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  32.41 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  24.18 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  35.87 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  23.31 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.22 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  26.57 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.23 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  31.58 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  24.06 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  30.34 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  26.38 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.77 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  23.31 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  24.55 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.79 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  27.71 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  22.62 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.72 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  24.66 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.42 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.35 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  29.68 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  22.75 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  26.92 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  25.16 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  27.11 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  24.86 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  23.81 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  22.22 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  24.72 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  29.38 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  28.1 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  27.54 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  25 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  27.06 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  27.65 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  29.92 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  30.06 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  27.32 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.95 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  30.71 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  25.79 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  26.88 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  29.24 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.9 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  25.9 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  28.31 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  22.98 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.23 
 
 		 833 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  27.34 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 280 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  22.92 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>