More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3594 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 402 aa  815    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  40.65 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  39.29 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  37.47 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  39.95 
 
 		 404 aa  282  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  40.36 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  39.53 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  37.06 
 
 		 408 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  37.66 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  37.87 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  37.97 
 
 		 413 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  36.02 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  40.05 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  36.29 
 
 		 406 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  36.34 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  36.86 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  37.62 
 
 		 405 aa  252  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  36.18 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  35.54 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  37.01 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  34 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  33.75 
 
 		 431 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  34.42 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  34.09 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 414 aa  232  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  34.15 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33.83 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  32.99 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  35.16 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  31.85 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.34 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  35.16 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  32.64 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  34.11 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  30.96 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  31.11 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  34.75 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  31.09 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.69 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  33.6 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  31.1 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  32.56 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  30.93 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  32.18 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  29.85 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33.71 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  30.24 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  30.24 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  31.64 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  32.19 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  30.6 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  30.59 
 
 		 447 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  29.37 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.48 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  28.61 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.94 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  26.53 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  28.84 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  25.3 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.88 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  29.35 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  26.97 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.02 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  24.16 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  24.79 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  26.37 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  24.16 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.51 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  23.85 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  23.03 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.21 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  27.55 
 
 		 242 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  30.18 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  23.33 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  32.3 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  26.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3136  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.51 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.882621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>