269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3300 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3300  EAL  100 
 
 		 417 aa  834    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  44.96 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  44.88 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  43.66 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  43.1 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  42.72 
 
 		 411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  44.64 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  42.37 
 
 		 411 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  43.24 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  41.34 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  41.71 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  41.48 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  41.81 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  44.96 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  45.8 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  39.36 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.91 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  36.89 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  36.32 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  32.6 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33.25 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  35.37 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  35.45 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.51 
 
 		 408 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  32.6 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  35.04 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33.81 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  33.91 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  31.53 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  35.49 
 
 		 423 aa  205  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  33.82 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  35.35 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  32.13 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 413 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  35.25 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  32.18 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.55 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  32.43 
 
 		 409 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  35.58 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  38.07 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  29.31 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  30.94 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  30.71 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  29.81 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  33.73 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  33.73 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  28.82 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  32.29 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  28.57 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  27.97 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  33.74 
 
 		 448 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  31.88 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  31.87 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  29.6 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  31.67 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.22 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  29.95 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  29.18 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  27.45 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.02 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  29.13 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  33.61 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  27.7 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  46.35 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  28.78 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 463 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  28.64 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.56 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.96 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.96 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.99 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  22.41 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.47 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  29.18 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  31.84 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  28.62 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  29.12 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  29.5 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.49 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  26.89 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  28.03 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  28.18 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  26.39 
 
 		 592 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>