More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0920 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 416 aa  830    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  44.5 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  37.4 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  42.17 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  39.65 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  35.24 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  39.9 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  37.28 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  36.34 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 397 aa  246  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  32.49 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.5 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.63 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.92 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  34.21 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  35.86 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  33.42 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  35.41 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  36.39 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  35.7 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  32.67 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  33.16 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  34.04 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  30.73 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  33.86 
 
 		 407 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  35.26 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  34.79 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  35.45 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  34.56 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  31.6 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  34.25 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  33 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  34.56 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  31.1 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  33.74 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  32.67 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  38.56 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  38.75 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  34.01 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  33.72 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  34.8 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  34.15 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  31.94 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.78 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  31.34 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  34.99 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  35.26 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  29.31 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  29.31 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  35.26 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 429 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  30.86 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  33.49 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.98 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.46 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  32.28 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  26.85 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  27.29 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.94 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  27.07 
 
 		 460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  27.56 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  28.07 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25.69 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.29 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  27.75 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.86 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  34.17 
 
 		 242 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  25.28 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  36.51 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.37 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  25.86 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  33.01 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.88 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  33.03 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  31.34 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  33.13 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.88 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  32.42 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>