82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0558 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  100 
 
 		 410 aa  804    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  57.49 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  56.4 
 
 		 403 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  55.18 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  48.16 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  28.15 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.25 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  31.21 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.69 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  31.03 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  27.39 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.79 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  23.93 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  23.93 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.02 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  29.56 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  28.12 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.13 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  25.65 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  27.89 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  25.64 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  31.41 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  25.78 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  28.96 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  23.05 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  33.13 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  27.6 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.16 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  27.81 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.73 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  27.66 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.51 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  28.24 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  30.36 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  28.21 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.6 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  28.75 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.18 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  25.15 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  27.98 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  28.47 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  24.87 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  26.36 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  20.51 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  23.21 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  29.57 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  32.62 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.5 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  24.84 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  28.34 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.73 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  23.24 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  21.83 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  25.95 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  30.64 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  21.76 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.56 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  24.07 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.97 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.87 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  20.93 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  22.61 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  25.37 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  25.7 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0972  signal transduction protein  27.74 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>