More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0413 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 397 aa  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  40.65 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  35.06 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.67 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  36.41 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  34.17 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  35.07 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  32.49 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  34.76 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  35.32 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  30.02 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.74 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  32.09 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  34.83 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  33.74 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  29.65 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  33.17 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.58 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.9 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  32.25 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  32.7 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 412 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  31.83 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  33.25 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  31.02 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  33.59 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  31.05 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  31.7 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  29.38 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.78 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  31.35 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  33.24 
 
 		 410 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  31.54 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.99 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  31.5 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  32.29 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  31.46 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.38 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  29.11 
 
 		 487 aa  186  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  27.85 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  29.83 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  32.05 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 		 424 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.56 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  30.19 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  28.04 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 447 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.15 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.3 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.3 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.23 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  28.87 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  30.21 
 
 		 410 aa  156  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  28.8 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  26.17 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  24.73 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.17 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  26.8 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  26.8 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  27.64 
 
 		 414 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  26.07 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  22.97 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  25.19 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  25.34 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  26.49 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.13 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  25.07 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  22.78 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  29.21 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  29.23 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  31.33 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  26.16 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.85 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  20.62 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06253  sensory transduction protein kinase  36.44 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.26 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  27.42 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  24.23 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000489  sensory box/GGDEF family protein  34.75 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  32.14 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>