More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2615 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  96.11 
 
 		 411 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 411 aa  826    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  64.3 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  52 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  50.74 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  50.98 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  50.12 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  52.7 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  48.14 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  46.8 
 
 		 411 aa  358  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  41.12 
 
 		 412 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  42.37 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  40.05 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  42.47 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  34.55 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  41.53 
 
 		 445 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  35.71 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  31.7 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  38.54 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  33.08 
 
 		 406 aa  222  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  35.02 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  32.52 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  34.89 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  32.52 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  32.35 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.56 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  30.27 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  29.06 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  31.7 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  33.25 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  32.28 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  33.41 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  31.7 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  32.98 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  30.51 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  30.29 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  31.5 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  31.54 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 431 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  30.79 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  29.95 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.38 
 
 		 423 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  31.01 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  29.74 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  32.2 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  27.72 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  28.84 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  28.27 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.02 
 
 		 400 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  29.9 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  29.47 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.39 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  30.73 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 487 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  28.78 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  34.39 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  32.36 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  31.13 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.03 
 
 		 480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.15 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  26.7 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.27 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  36.71 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.07 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.3 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  25.3 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.37 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.51 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.58 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.82 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  32.5 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  22.3 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  28.38 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  27.89 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  22.29 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  25.51 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  29.73 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.43 
 
 		 1016 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.83 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>