More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1937 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  100 
 
 		 400 aa  821    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  58.69 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  57.68 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  47.19 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  46.8 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  44.28 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  44.36 
 
 		 407 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  37.62 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  38.71 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  36.25 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  37.88 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  36.59 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  37.38 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  40 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  39.05 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  40.36 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  38.85 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  33.83 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  33.16 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  36.59 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  32.09 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.91 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.49 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.9 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.5 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  29.85 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  31.94 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.18 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.94 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  30.48 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.52 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  29.35 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.59 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  28.07 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.55 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  27.97 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  29.16 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.83 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  28.85 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.59 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 429 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  29.76 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.42 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  30.87 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  30.94 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  26 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 428 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  29.07 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  27.23 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  28.03 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  26.94 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.89 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  26.55 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  27.3 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  28.87 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.43 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  24.42 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.95 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  26.91 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  24.49 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  22.84 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  31.76 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  24.8 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.66 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  23.1 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  25.42 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  26.53 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  23.54 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  21.72 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  29.56 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.19 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3143  diguanylate phosphodiesterase  28.97 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.375725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.45 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000652876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  25.84 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.23 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1101  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.36 
 
 		 1092 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>