198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1990 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 414 aa  844    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  40.16 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  38.07 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  37.84 
 
 		 431 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  37.41 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  38.71 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  31.19 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.13 
 
 		 413 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  34.03 
 
 		 487 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.93 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  31.37 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  30.25 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  31.6 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  32.45 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  29.88 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  31.85 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  31.51 
 
 		 408 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  30.38 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  31.51 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  30.62 
 
 		 413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  29.82 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  32.53 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  30.35 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  29.67 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.45 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.32 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.34 
 
 		 412 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  29.28 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  29.47 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  29.15 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  29.16 
 
 		 400 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.3 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  31.27 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  30.65 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  32.58 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  30.98 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  27.65 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  30.81 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  27.62 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  27.13 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  27.32 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  31.61 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.05 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  29.58 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  26.44 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.82 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  29.37 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  28.42 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.79 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  27.44 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  24.38 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.02 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.99 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  27.71 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  30.86 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.11 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  23.5 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.43 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  24.46 
 
 		 450 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  29.03 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.94 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  28.87 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  23.68 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.74 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.29 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.29 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  31.82 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.8 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  22.56 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.36 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  30.6 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  26.85 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  25 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>