More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3736 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 406 aa  830    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  33.59 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  35.23 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.83 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  34.65 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  30.33 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.17 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.88 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  32.99 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  28.99 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  29.6 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 400 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  34.99 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  31 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  31.57 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  29.38 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  31.52 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  33.6 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  30.5 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  30.67 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  32.35 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  30.41 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  31.4 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  29.15 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  28.78 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  32.7 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  31.54 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  28.5 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  32.58 
 
 		 423 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  29.63 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  29.86 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  31.15 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  29.4 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  29.61 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  32.63 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  27.79 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  26.37 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  28.04 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  29.63 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  32.8 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  28.15 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  28.93 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.54 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  30.35 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  28.29 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  29.28 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.6 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 431 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  27.99 
 
 		 428 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.21 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  28.67 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  28.11 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  28.57 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  26.08 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  28.7 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.78 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  24.86 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  26.86 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  24.16 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  23.71 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  23.7 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  26.13 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 		 242 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  26.03 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  23.57 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  22.25 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  24.62 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.56 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.28 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 289 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.32 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  37.7 
 
 		 931 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  27.37 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  28.39 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  28.39 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  28.39 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  28.39 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  28.39 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2600  EAL domain-containing protein  30.49 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.998964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.32 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>