More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0993 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 441 aa  918    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  43.07 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  41.77 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  43.56 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  43.69 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  43.85 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  42.89 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  42.89 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  42.89 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  42.53 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  41.31 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  40.05 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  41.49 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  41.49 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  39.37 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  41.49 
 
 		 515 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  40.98 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  35.5 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 428 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  37.34 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  39.66 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  34.4 
 
 		 423 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  33.57 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  33.58 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  34.34 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  34.34 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  34.34 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  34.34 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  34.34 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  34.85 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  33.57 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  34.6 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  34.85 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 447 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  34.85 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.85 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  34.67 
 
 		 424 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.85 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.85 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  34.21 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  34.85 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  33.49 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  34.35 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.25 
 
 		 777 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.41 
 
 		 780 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.41 
 
 		 790 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 414 aa  212  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  35.89 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  28.99 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  40.77 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  40.77 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  40.77 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  30.44 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  28.96 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  37.85 
 
 		 197 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  37.99 
 
 		 592 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  29.23 
 
 		 387 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  28.61 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.94 
 
 		 584 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  34.04 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  34.47 
 
 		 582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  30.54 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  30.54 
 
 		 360 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.74 
 
 		 596 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  33.33 
 
 		 590 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.73 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  29.39 
 
 		 266 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.3 
 
 		 766 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  34.16 
 
 		 936 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4784  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.02 
 
 		 785 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  31.2 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31 
 
 		 632 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  31.67 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  32.01 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  33.33 
 
 		 590 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  32.01 
 
 		 567 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.72 
 
 		 773 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  31.69 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  31.65 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  32.32 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  32.32 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  32.32 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  32.32 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  32.32 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.74 
 
 		 599 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  33.19 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.68 
 
 		 605 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>