More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0612 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  39.53 
 
 		 419 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  37.85 
 
 		 441 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  41.48 
 
 		 411 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  38.01 
 
 		 424 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  35.26 
 
 		 427 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  36.21 
 
 		 429 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  36.21 
 
 		 515 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  36.21 
 
 		 464 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  36.21 
 
 		 464 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  35.63 
 
 		 425 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  35.03 
 
 		 428 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  35.03 
 
 		 422 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  34.86 
 
 		 428 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  34.29 
 
 		 428 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  33.71 
 
 		 428 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  32.57 
 
 		 428 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  32.57 
 
 		 428 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  32.57 
 
 		 428 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 428 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 423 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  33.91 
 
 		 423 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.97 
 
 		 780 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 447 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 426 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.7 
 
 		 790 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  28.74 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  29.89 
 
 		 436 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.24 
 
 		 777 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 436 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  31.21 
 
 		 440 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  30.64 
 
 		 446 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  30.85 
 
 		 403 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  30.32 
 
 		 427 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  30.32 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  28.65 
 
 		 424 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 422 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  28.65 
 
 		 424 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  28.65 
 
 		 422 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  32.42 
 
 		 421 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 422 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 422 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  37.3 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  29.73 
 
 		 424 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  28.11 
 
 		 424 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  28.11 
 
 		 424 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  28.57 
 
 		 424 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 424 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 424 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 424 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  29.94 
 
 		 474 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  27.57 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  29.94 
 
 		 474 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  34.46 
 
 		 413 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  29.94 
 
 		 482 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  27.57 
 
 		 424 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  30.23 
 
 		 414 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  29.24 
 
 		 427 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  34.25 
 
 		 429 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 357 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 379 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  34.5 
 
 		 306 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0898  hypothetical protein  31.28 
 
 		 284 aa  91.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.41 
 
 		 766 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30 
 
 		 753 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 263 aa  85.5  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  36.07 
 
 		 257 aa  85.5  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  32.93 
 
 		 425 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2106  diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 		 290 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2943  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 		 816 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  31.79 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.68 
 
 		 773 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  30.92 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.28 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29.28 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  32.24 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  30.54 
 
 		 592 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  32.56 
 
 		 582 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.28 
 
 		 584 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  28.49 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.6 
 
 		 596 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  30.52 
 
 		 475 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  29.48 
 
 		 387 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.81 
 
 		 893 aa  81.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 		 676 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.55 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.65 
 
 		 883 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.97 
 
 		 797 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.76 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 585 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  27.01 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  26.35 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1640  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.92 
 
 		 879 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.73 
 
 		 583 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>