More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3246 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 443 aa  906    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 452 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 451 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.7 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 470 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.12 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.08 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.69 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.31 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.91 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.81 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  33.54 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  31.79 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  33.76 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.23 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  31.21 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.43 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  29.05 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.42 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.85 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.01 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.63 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  30.77 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>