169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2941 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  100 
 
 
342 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  38.58 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  37.35 
 
 
347 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  37.15 
 
 
346 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  37.61 
 
 
347 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  36.81 
 
 
346 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  35.12 
 
 
360 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  34.15 
 
 
362 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  33.43 
 
 
366 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  33.04 
 
 
357 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  35.37 
 
 
362 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  34.67 
 
 
368 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  33.23 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  34.36 
 
 
357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  34.02 
 
 
321 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  34.06 
 
 
364 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  34.7 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
370 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  36.54 
 
 
375 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  31.82 
 
 
366 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  33.75 
 
 
361 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  30.68 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  27.42 
 
 
545 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  27.98 
 
 
535 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  26.59 
 
 
477 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  29.73 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  27.27 
 
 
573 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  28.81 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  27.92 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  30 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  28.02 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  27.12 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  26.88 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  29.55 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.09 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  25.81 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.39 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  28.03 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.33 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  27.52 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.23 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  25.35 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  24.73 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  28.98 
 
 
453 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  25.25 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.41 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  27.14 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.12 
 
 
466 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.12 
 
 
465 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  27.63 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5676  fatty acid desaturase  22.55 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.754499  normal  0.384485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  22.54 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  26.33 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.24 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  25.66 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  25.94 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  27.21 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  25 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.4 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  27.13 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  25.77 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  26.89 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  25.09 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  23.83 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  25.27 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  22.56 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  38.67 
 
 
427 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  25 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  25.55 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  34.78 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  29.93 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  21.88 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  25.08 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  28.32 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  39.06 
 
 
760 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  36 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  35.06 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  38.33 
 
 
469 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  36 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
374 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  23.75 
 
 
357 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>