More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3569 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  54.27 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  55.07 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  48.97 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  46.02 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  46.37 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  45.33 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  44.8 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  45.67 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  44.8 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  47.83 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  47.83 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  47.43 
 
 		 310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  47.43 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  49.3 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  49.3 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  47.43 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  45.36 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  44.17 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  46.64 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  47.29 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  42.71 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  45.08 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  44.98 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  39.26 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  42.96 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  42.14 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  44.56 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  43.3 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  42.14 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  42.65 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  43.14 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  45.92 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  44.92 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  45.73 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  46.64 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  41.9 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  44.31 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  45.56 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  41.55 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  44.18 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  44.16 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  44.6 
 
 		 315 aa  198  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  41.94 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.72 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  44.05 
 
 		 347 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  45.42 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  44.36 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  46.9 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  44.24 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  44.92 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  46.51 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  39.51 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  45.31 
 
 		 291 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  44.05 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  44.05 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  41.55 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  41.04 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  43.17 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  44.66 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.62 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  46.06 
 
 		 336 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  39.5 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.96 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  47.87 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>