More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3184 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
162 aa  321  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  38.05 
 
 
201 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
194 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
148 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
142 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.48 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
203 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.09 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.21 
 
 
178 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.86 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  29.69 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.86 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.86 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
160 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.89 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>