247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1052 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1362 aa  2767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 
1144 aa  325  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.43 
 
 
984 aa  268  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  32.67 
 
 
962 aa  267  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.61 
 
 
971 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.65 
 
 
878 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
906 aa  209  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  40.43 
 
 
850 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.25 
 
 
674 aa  167  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.08 
 
 
962 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.16 
 
 
815 aa  161  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.19 
 
 
987 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.71 
 
 
1158 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 
752 aa  155  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  38.49 
 
 
1581 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 
915 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.86 
 
 
581 aa  140  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.91 
 
 
1441 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.32 
 
 
578 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.14 
 
 
1564 aa  133  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.91 
 
 
4013 aa  128  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  27.15 
 
 
813 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  33.45 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  37.28 
 
 
578 aa  118  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 
1243 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  24.72 
 
 
1270 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  32.89 
 
 
1471 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.5 
 
 
835 aa  110  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.35 
 
 
756 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  25.82 
 
 
837 aa  105  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.62 
 
 
842 aa  105  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.51 
 
 
845 aa  105  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.77 
 
 
744 aa  103  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 
637 aa  102  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  28.33 
 
 
837 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.56 
 
 
1007 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 
763 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.96 
 
 
755 aa  99.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  38.16 
 
 
433 aa  99.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.4 
 
 
872 aa  98.2  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  33.98 
 
 
558 aa  97.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  40.15 
 
 
999 aa  97.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.23 
 
 
813 aa  97.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  33.91 
 
 
1028 aa  96.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  23.03 
 
 
824 aa  96.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  28.57 
 
 
864 aa  95.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45.38 
 
 
801 aa  95.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.17 
 
 
639 aa  95.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  39.39 
 
 
1103 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.8 
 
 
940 aa  94.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.07 
 
 
953 aa  91.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  22.42 
 
 
819 aa  91.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  40 
 
 
392 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  39.1 
 
 
1070 aa  90.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  38.46 
 
 
1059 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  39.42 
 
 
732 aa  90.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 
1321 aa  90.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  23.06 
 
 
846 aa  90.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.82 
 
 
1117 aa  89.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.85 
 
 
722 aa  89  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
786 aa  88.6  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  25.39 
 
 
823 aa  88.6  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.68 
 
 
1060 aa  88.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  38.97 
 
 
571 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25 
 
 
819 aa  88.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.72 
 
 
1139 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.64 
 
 
695 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  22.3 
 
 
815 aa  87.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.62 
 
 
929 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  22.42 
 
 
819 aa  87  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
863 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 
785 aa  87  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.75 
 
 
819 aa  86.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  38.89 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  27.98 
 
 
840 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  38.81 
 
 
1059 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  37.41 
 
 
1338 aa  84  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  40.91 
 
 
879 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  23.92 
 
 
839 aa  84  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.76 
 
 
1448 aa  83.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 
897 aa  82  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 
793 aa  82  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  24.15 
 
 
880 aa  81.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  26.17 
 
 
824 aa  81.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  25.83 
 
 
831 aa  80.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  23.33 
 
 
860 aa  80.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 
891 aa  80.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  27.42 
 
 
833 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  28.03 
 
 
861 aa  77.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.78 
 
 
845 aa  77  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 
1332 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  23.57 
 
 
875 aa  76.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  30.56 
 
 
768 aa  76.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
871 aa  76.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
1184 aa  75.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  23.24 
 
 
891 aa  75.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  27.88 
 
 
812 aa  75.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.48 
 
 
802 aa  73.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  39.13 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  35.83 
 
 
802 aa  72.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>