More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0791 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  286  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  51.28 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.08 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 165 aa  66.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  25.64 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  24.68 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>