233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02960 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  64.68 
 
 		 1077 aa  1245    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  100 
 
 		 1090 aa  2271    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  55.45 
 
 		 797 aa  936    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  37.8 
 
 		 466 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  38.68 
 
 		 479 aa  249  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  33.81 
 
 		 754 aa  248  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.25 
 
 		 635 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.91 
 
 		 655 aa  238  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  34.7 
 
 		 952 aa  234  7.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.54 
 
 		 636 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 		 636 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.27 
 
 		 632 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30.78 
 
 		 716 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.12 
 
 		 622 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.94 
 
 		 619 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  31.78 
 
 		 622 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  34.64 
 
 		 388 aa  214  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  33.94 
 
 		 651 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  34.64 
 
 		 2245 aa  213  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  42.86 
 
 		 268 aa  211  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  32.05 
 
 		 686 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.74 
 
 		 643 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  28.67 
 
 		 633 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.26 
 
 		 609 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.76 
 
 		 611 aa  198  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  30.62 
 
 		 1999 aa  197  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  34.46 
 
 		 464 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  29.23 
 
 		 795 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  32.14 
 
 		 650 aa  186  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  27.52 
 
 		 633 aa  186  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.91 
 
 		 633 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  32.14 
 
 		 650 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.98 
 
 		 748 aa  178  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.52 
 
 		 1048 aa  176  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.92 
 
 		 633 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.59 
 
 		 1097 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.54 
 
 		 715 aa  163  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  35.35 
 
 		 1189 aa  160  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  35.03 
 
 		 315 aa  153  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  31.03 
 
 		 1038 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.53 
 
 		 986 aa  152  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.52 
 
 		 629 aa  147  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.45 
 
 		 521 aa  147  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.01 
 
 		 752 aa  146  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  31 
 
 		 934 aa  145  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.78 
 
 		 902 aa  145  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.97 
 
 		 902 aa  141  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  34.16 
 
 		 553 aa  140  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  34.16 
 
 		 553 aa  140  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.49 
 
 		 1099 aa  140  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.66 
 
 		 901 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  31.58 
 
 		 1653 aa  125  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.01 
 
 		 606 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.35 
 
 		 486 aa  121  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.65 
 
 		 941 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30.56 
 
 		 1651 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  27.89 
 
 		 759 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.66 
 
 		 769 aa  112  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.76 
 
 		 297 aa  111  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  28.02 
 
 		 769 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.68 
 
 		 585 aa  111  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  28.12 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.21 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.98 
 
 		 759 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.98 
 
 		 759 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  30.99 
 
 		 1585 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  30.99 
 
 		 1585 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.98 
 
 		 759 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.76 
 
 		 759 aa  108  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.76 
 
 		 759 aa  108  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.76 
 
 		 759 aa  108  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  29.3 
 
 		 944 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1018 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.95 
 
 		 1108 aa  106  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.18 
 
 		 237 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 2310 aa  105  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  28.22 
 
 		 1427 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.96 
 
 		 1408 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1116 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.32 
 
 		 1620 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  29.97 
 
 		 1422 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.32 
 
 		 1111 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.48 
 
 		 1190 aa  95.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1172 aa  94.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.71 
 
 		 283 aa  94  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 		 1284 aa  92.8  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1350 aa  87  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1126 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  30.32 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.88 
 
 		 1428 aa  82  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  22.44 
 
 		 1250 aa  81.6  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.53 
 
 		 1403 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  24.08 
 
 		 1427 aa  79  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.89 
 
 		 1151 aa  78.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  27.72 
 
 		 1126 aa  77.8  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  26.08 
 
 		 659 aa  77.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  23.78 
 
 		 1261 aa  77  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1139 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.43 
 
 		 1324 aa  75.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.66 
 
 		 1082 aa  75.5  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>