More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1913 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  75.17 
 
 
315 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  74.67 
 
 
315 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  59.67 
 
 
315 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  54.15 
 
 
312 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  47.7 
 
 
307 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
308 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  48.2 
 
 
307 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  50.49 
 
 
323 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  48.34 
 
 
307 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  45.7 
 
 
299 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 
315 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  42.38 
 
 
301 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
317 aa  265  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.52 
 
 
324 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
320 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  42.17 
 
 
314 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  55.9 
 
 
512 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.28 
 
 
311 aa  255  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  46.15 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  42.72 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.39 
 
 
322 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  42.71 
 
 
325 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  42.16 
 
 
335 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  49.25 
 
 
1171 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
323 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.31 
 
 
510 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.19 
 
 
305 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  43.93 
 
 
310 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  40.45 
 
 
312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  43.71 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.05 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  46.93 
 
 
1106 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 
308 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  44.59 
 
 
590 aa  241  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.13 
 
 
590 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  43.43 
 
 
333 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  39.8 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  44.3 
 
 
317 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.26 
 
 
308 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.16 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.37 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  44.44 
 
 
314 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  43.59 
 
 
592 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
592 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  50.2 
 
 
578 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  41.88 
 
 
593 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  48.1 
 
 
599 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.45 
 
 
667 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  40.78 
 
 
579 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  47.1 
 
 
588 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.3 
 
 
308 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  37.35 
 
 
340 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.54 
 
 
322 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  39.48 
 
 
346 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  44.37 
 
 
310 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.02 
 
 
594 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 
576 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  41.16 
 
 
354 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 
327 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  44.37 
 
 
310 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  36.93 
 
 
323 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  39.16 
 
 
346 aa  225  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
309 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  40.52 
 
 
575 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 
322 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  39.4 
 
 
346 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  42.36 
 
 
599 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  43.71 
 
 
310 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
322 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  41.84 
 
 
580 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
312 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  42.19 
 
 
322 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  39.4 
 
 
318 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  39.4 
 
 
318 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
585 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
583 aa  221  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
309 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  39.4 
 
 
318 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  39.4 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  41.06 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  43.1 
 
 
583 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.2 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
578 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
580 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.98 
 
 
580 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
578 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
578 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
578 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
578 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
578 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 
578 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
578 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  42.36 
 
 
578 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>