133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3224 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  100 
 
 		 386 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  32.7 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  32.25 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  32.7 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  32.17 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  27.53 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.95 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.6 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  31.52 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.83 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.75 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  22.77 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.36 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.51 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.23 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.03 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>