More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6488 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  31.21 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  31.46 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  34.02 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 346 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 		 607 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.02 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  28.41 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  32.25 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  31.48 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.12 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  32.2 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  29.19 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>