More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6220 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  61.74 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  52.59 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  49.78 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  50.44 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  48.67 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  48.23 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  44.25 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  39.73 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  44.84 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  40.43 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  43.91 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  38.7 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  37.83 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  38.22 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  37.83 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  42.4 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  40.54 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  44.51 
 
 		 198 aa  147  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  41.52 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.82 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  36.4 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  33.19 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  39.66 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  44.59 
 
 		 339 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  47.97 
 
 		 348 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.24 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  37.02 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.68 
 
 		 339 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  41.72 
 
 		 147 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  46.94 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.36 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.82 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.07 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  38.93 
 
 		 149 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  44 
 
 		 332 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.17 
 
 		 132 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  37.24 
 
 		 155 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  41.72 
 
 		 330 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  36.73 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 		 153 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 		 149 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.16 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  36.84 
 
 		 151 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 154 aa  94.7  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  37.76 
 
 		 149 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 149 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.37 
 
 		 152 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 		 120 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 149 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  33.19 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.49 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  36.49 
 
 		 153 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 150 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.17 
 
 		 155 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 150 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  35.17 
 
 		 196 aa  88.6  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 427 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  31.45 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  36.55 
 
 		 155 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.24 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.97 
 
 		 150 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  33.56 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.73 
 
 		 153 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.53 
 
 		 150 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  30.63 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  32.56 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.92 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.34 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.73 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.76 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  31.77 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.19 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32.72 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32 
 
 		 873 aa  79  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 845 aa  79  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.25 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.69 
 
 		 628 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  31.58 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  34.93 
 
 		 156 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  34.25 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  32.24 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  37.93 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  30.88 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>