197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0084 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  99.49 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  92.35 
 
 		 196 aa  350  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  77.27 
 
 		 195 aa  285  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  82.49 
 
 		 199 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  68.88 
 
 		 197 aa  277  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  68.37 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  70.98 
 
 		 195 aa  261  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  57.87 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  57.87 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  58.43 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  57.39 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  56.25 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  56.74 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  56.82 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  56.42 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  54.55 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  55.62 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  55 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  58.76 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  48.31 
 
 		 179 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  50.84 
 
 		 191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  48.31 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  47.19 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  44 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.96 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.64 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  35.42 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.03 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 177 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.36 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  32.06 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  32.04 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  33.59 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.21 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  27.33 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  35.43 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  33.93 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  31.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  31.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  31.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  31.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  31.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  32.5 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.07 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  29.92 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  32.67 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.37 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  29.92 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.12 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  25.61 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.13 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.34 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3745  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  28.46 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  24.42 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  25.61 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  32.12 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0580  2'-5' RNA ligase  27.15 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  24 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  31.62 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3871  2'-5' RNA ligase  26.82 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0606151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.7 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  27.67 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3688  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.31 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>