114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0545 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  75.32 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  71.43 
 
 		 242 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  71.88 
 
 		 242 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  73.21 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  49.55 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  39.5 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  39.92 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  39.33 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.09 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  42.14 
 
 		 534 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.56 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  31.69 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.74 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  41.91 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.64 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  40.41 
 
 		 161 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.91 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  31.36 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.13 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  37.01 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  37.41 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  37.09 
 
 		 158 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  35.19 
 
 		 167 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  37.24 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  37.24 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 208 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  37.34 
 
 		 166 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.92 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  30.93 
 
 		 220 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  36.81 
 
 		 185 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  37.59 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.41 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  32.58 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  34.88 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  34.11 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.87 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  35.71 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.08 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.4 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  27.08 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  35.53 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  34.78 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.21 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.53 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  31.58 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.3 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  38.57 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.31 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.3 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.3 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.44 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.3 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  51.92 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.66 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.72 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  32.08 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  54.72 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  32.35 
 
 		 169 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  28.3 
 
 		 155 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.73 
 
 		 180 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  28.74 
 
 		 187 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  28.91 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.61 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  24.7 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  33.59 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  32.94 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  30.82 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  31.76 
 
 		 329 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  32.23 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  29.31 
 
 		 178 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  26.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  27.61 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.12 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 		 162 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  48.98 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.95 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.2 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  35.05 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  25.13 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  28.24 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>