More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2563 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
935 aa  1907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
922 aa  831    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  77.25 
 
 
945 aa  1448    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.9 
 
 
811 aa  446  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  47.72 
 
 
781 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
937 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
750 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  42.81 
 
 
2051 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
865 aa  348  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
939 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
784 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
721 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
989 aa  333  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
989 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
720 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1323 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
1611 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
1578 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
929 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
1068 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  36.31 
 
 
1323 aa  293  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
770 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
1187 aa  291  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1058 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.18 
 
 
1257 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.7 
 
 
810 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1285 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  38.52 
 
 
902 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1002 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1002 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  38.27 
 
 
902 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  34.69 
 
 
1161 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1146 aa  278  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.41 
 
 
757 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.3 
 
 
1028 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  36.91 
 
 
583 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1127 aa  275  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
1178 aa  272  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
1124 aa  271  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1154 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1090 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
841 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
1090 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1127 aa  266  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1002 aa  265  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  34.13 
 
 
1132 aa  264  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1099 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.47 
 
 
1023 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1140 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1140 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  33.58 
 
 
1140 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1193 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1193 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  38.05 
 
 
800 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1322 aa  257  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  39.29 
 
 
794 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
1672 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  34.93 
 
 
1140 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
606 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 
744 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  35.66 
 
 
1153 aa  255  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
865 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
1130 aa  255  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
1064 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.84 
 
 
1361 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
917 aa  254  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
873 aa  254  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
860 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
970 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1013 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
807 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1927 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
822 aa  252  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.53 
 
 
1560 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1202 aa  251  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
945 aa  251  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.56 
 
 
655 aa  250  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
759 aa  250  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.33 
 
 
659 aa  250  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  34.54 
 
 
1220 aa  250  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
881 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
870 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  32.88 
 
 
1128 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.09 
 
 
1060 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  36.34 
 
 
1121 aa  248  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1303 aa  248  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.05 
 
 
882 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1362 aa  247  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
844 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1016 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
844 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1362 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
1271 aa  247  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1128 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1126 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1120 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
902 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
947 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
977 aa  246  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 
1392 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>